يتكون الهيكل التنظيمي لمكتب دعم السياسات العامة من التقسيمات التنظيمية التالية:
- المدير العام
- أمانة سر المكتب
- وحدة الشؤون الإدارية والمالية
- وحدة الشؤون القانونية
- وحدة المراجعة الداخلية
- وحدة العلاقات العامة
- وحدة التخطيط والمتابعة
- وحدة السياسات الخارجية
- وحدة الرصد الإعلامي
- وحدة اللجان وفرق المشاريع